Mặc dù LINE Pay có nhiều lợi ích đối với thanh toán sòng bạc trực tuyến, nhưng có một số nhược điểm khi sử dụng dịch vụ thanh toán này. Một hạn chế đáng kể là không phải tất cả các sòng bạc trực tuyến đều chấp nhận LINE Pay. Mặc dù nhiều sòng bạc trực tuyến đã tích hợp LINE Pay, nhưng nó có thể không khả dụng ở tất cả các sòng bạc, hạn chế việc sử dụng đối với một số người chơi. Ngoài ra, trong khi LINE Pay có phí giao dịch thấp, một số sòng bạc trực tuyến có thể tính thêm phí khi sử dụng LINE Pay, làm giảm khả năng chi trả của người dùng.
Một hạn chế khác là người dùng phải có tài khoản LINE và ví LINE để sử dụng LINE Pay, điều này có thể không khả thi đối với tất cả người dùng. Ngoài ra, người dùng có thể gặp sự cố với giới hạn tiền gửi và rút tiền, tùy thuộc vào chính sách của sòng bạc trực tuyến.
Vì vậy, trong khi LINE Pay cung cấp dịch vụ thanh toán nhanh chóng, an toàn và giá cả phải chăng cho các sòng bạc trực tuyến, người dùng nên biết những hạn chế và nhược điểm của nó và cân nhắc các lựa chọn trước khi sử dụng dịch vụ thanh toán này.